jQueryMobileでページがロードされたとき、DOMが出来上がったときのイベントがとれなかった、たしかに考えると、Ajaxで読み込んだ場合どうなるのかよく分かってなかった。以下に要点まとめ

ヘッダ(<head>)は全ページ同じにすべし

まず、jQueyrMobileは基本Ajaxで読込するので、jQeuryとかのライブラリとか、全ページ<head>内で読み込んで居るととんでもなくわけわかんなくなる。
ダブりで読んだりが大変！

そこで、１ページめは普通に読み込んで２ページ目移行（Ajax遷移するばあい）は、<head>の方の読込は無視らしい。

つまり、直リンクで色んなページに来る可能性があるから、全ページ<head>にいろいろ書いておくべし＆同じ内容にしていないと、（ページごとで読み込むファイルがちがうとか）面倒なことになるので同じにしとくべしです。

 ページ読み込み時のイベントの設定

またページ読み込み時のイベントもいつもと違う。

$(function(){ });とかでもイベントが発生しないので、Ajax読み込み後のイベントを取る必要がある。

$(document).live( ‘pageinit’,function(event){
//hogehoge fuga
});

とすればOK